小龙虾没有烹煮到一定时间会导致中毒，由于烧煮时间不够，小龙虾的细菌没有完全消灭，很容易食物中毒。

由于市场上对小龙虾有很大的需求，小龙虾一般都是从外地购买的，尤其在夏季的高温影响下，经过长途运输，致使大量的小龙虾死亡，个别的饭店会将死龙虾油炸后再出售。小龙虾内含有大量的组氨酸，小龙虾的死亡会使组氨酸变成有毒的物质，虽然食用少量的小龙虾不会立刻中毒，但等毒素积累到一定程度会引起疾病。

另外，小龙虾有肺吸虫的滞留，如果没有把小龙虾烹饪煮熟，或是用烤、炒、腌、醉的烹调方法，一旦食用之后就会使人感染肺吸虫病。在食用小龙虾时，如果发现小龙虾的尾巴没有蜷曲，吃起来肉很松散，就可能是死龙虾，一定不要食用了。每次也不宜吃太多的小龙虾。